中共佛山市南海区纪律检查委员会与佛山市南海区监察委员会合署办公，内设职能部门和派驻（出）机构。设有区纪委监委派驻（出）机构21个，具体如下：

区纪委监委驻区委办公室、区政府办公室纪检监察组
区纪委监委驻区委组织部纪检监察组

区纪委监委驻区委宣传部纪检监察组
区纪委监委驻区委政法委纪检监察组

区纪委监委驻区人民法院纪检监察组

区纪委监委驻区人民检察院纪检监察组
区纪委监委驻区发展和改革局纪检监察组
区纪委监委驻区教育局纪检监察组
区纪委监委驻区经济促进局纪检监察组
区纪委监委驻区民政局纪检监察组
区纪委监委驻区财政局纪检监察组
区纪委监委驻区住房城乡建设和水利局纪检监察组
区纪委监委驻区交通运输局纪检监察组
区纪委监委驻区卫生健康局纪检监察组
区纪委监委驻区应急管理局纪检监察组
区纪委监委驻区国有资产监督管理局纪检监察组
区纪委监委驻区市场监督管理局纪检监察组
区纪委监委驻市公安分局南海分局纪检监察组
区纪委监委驻市自然资源局南海分局纪检监察组

区纪委监委驻佛山西站建设管理局纪检监察组
西樵山风景名胜区管理委员会纪检监察工作委员会